- Esta música é sobre um homem que se separou recentemente de sua esposa, Isis. Ele deixa a cidade em cima de um pônei dirigido 'para o país selvagem desconhecido'. Ao longo de seu caminho, ele encontra um personagem obscuro e os dois começam uma busca por tesouros. Durante a viagem, o homem fica pensando na ex-mulher:
Enquanto cavalgávamos pelos desfiladeiros, pelo frio diabólico
Eu estava pensando em Isis, como ela pensou que eu era tão imprudente
O personagem sombrio morre no meio da viagem, deixando o homem para continuar a caça ao tesouro sozinho:
Quando ele morreu eu esperava que não fosse contagioso
Mas eu decidi que eu tinha que continuar
Ao chegar ao túmulo onde está o suposto tesouro, o homem fica chocado ao encontrar um caixão vazio:
Não havia jóias sem nada, eu senti que tinha sido
Frustrado, ele arrasta sua companheira morta para o caixão, antes de decidir voltar para casa para Isis, 'só para dizer a ela que a amo'.
Depois de questionar seu paradeiro recente, Isis aceita seu ex-marido de volta. A música então termina com o homem refletindo sobre Ísis e sua influência magnética:
Isis oh Isis você é uma criança mística
O que me leva a você é o que me deixa louco - Isso foi escrito enquanto Dylan estava se separando de sua então esposa, Sara, portanto, muitos fãs acreditam que essa música faz alusão ao relacionamento turbulento do casal. Este argumento é apoiado pelo fato de constar no álbum, Desejo , que termina com a pungente 'Sara', durante a qual Dylan canta abertamente sobre sua 'jóia radiante, esposa mística'. Essa abordagem biográfica da escrita foi um feito raro para Dylan, que geralmente preferia escrever sob personas (como em 'Isis').
- Uma versão ao vivo de 'Isis' aparece no álbum de compilação, biógrafo . Dylan a apresenta como 'uma música sobre casamento'.
- A personagem feminina nesta música tem o nome de Ísis, a deusa da mitologia egípcia antiga que é idolatrada como a esposa ideal e mãe protetora.
- 'Isis' foi uma das sete músicas em Desejo co-escrito entre Dylan e o compositor/diretor de teatro, Jacques Levy.
- Em seus primeiros anos, The White Stripes frequentemente cobria essa música.
- O co-autor da música, Jacques Levy, foi convidado pelo fanzine de Dylan Ísis sobre este título de música e seu significado na mitologia egípcia. Levy respondeu que era uma tentativa de uma velha balada ocidental como a que The Band costumava escrever: sei, bem, 'Isis' tem tanto a ver com o Egito quanto Fanny tem a ver com Nazaré.'